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Tequio 4(11), 2021: 41-52
issn: 2594-0546

Modelo de estimación de pesos de árbol

filogenético para un cuartet, aplicando

conjugación de Hadamard

Estimation model of phylogenetic tree weights
on a quartet through Hadamard conjugation

Ernesto Álvarez-González 1

Fecha de recepción: 30 de octubre de 2020
Fecha de aceptación: 23 de diciembre de 2020

Resumen - El tema de este artículo es la parte de la Abstract - The subject on this paper is that part of
filogenética algebraica que propone una metodología algebraic phylogenetics which proposes a method
para inferir los valores esperados de tres tipos de to infere the expected values of three kinds of
sustituciones de nucleótidos sobre las ramas de nucleotide substitutions on the branches of a
un árbol filogenético que explica las relaciones phylogenetic tree that explains the ancestral relations
ancestrales de un conjunto de linajes asociado. Se among an associated set of lineages. A tool known as
ilustra una herramienta conocida como conjugación de Hadamard conjugation is presented, which --because
Hadamard, que por relacionar tanto la distribución de it connects both the probability distribution of the
probabilidad de los diferentes patrones de sustitución different substitution patterns on the leaves of the
sobre las hojas del árbol filogenético, como el conjunto phylogenetic tree, and the complete set of expected
completo de valores esperados de sustituciones sobre values of substitutions on its branches-- may indeed
sus ramas, promete ser un recurso de reconstrucción be a resource to phylogenetic reconstruction. Based
filogenética. Con base en esta técnica se construye on this, a likelihood function is built for a quartet
una función de verosimilitud para un cuartet asociado associated with an alignment of four nucleotide
a un alineamiento de cuatro secuencias de nucleótidos. sequences.

Palabras clave: Reconstrucción Keywords: Phylogenetic reconstruction, Hadamard
filogenética, conjugación de Hadamard, Conjugation, Maximum Likelihood Estimation.
estimación de máxima verosimilitud.

1. Introducción

a reconstrucción filogenética es un área de investigación actual que ofrece explicar todas las relaciones
ancestrales de un conjunto de especies (Cifuentes, 2015, p. 1). Esta reconstrucción demanda el conocimiento
Lde un árbol filogenético como modelo de especiación, así como de un modelo de evolución molecular (Hendy &

1 Estudiante de Doctorado, Facultad de Matemáticas, Universidad Complutense de Madrid, España. Profesor de Matemáticas en la Escuela de Ciencias
de la Universidad Autónoma “Benito Juárez” de Oaxaca, México. ORCID: 0000-0001-5795-8752