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88 Métodos de reconstrucción filogenética II/Duchen/81-89

RevBayes. Desarrollado por Höhna et al. (2016), sus funciones comprenden inferencia filogenética, MCMC,
relojes moleculares, selección de modelos, estimación de tasas de diversificación, etcétera. Este programa
incluye su propio intérprete, lo que lo hace particularmente útil a la hora de desarrollar tareas más complejas.

Figura 1.
Topologías posibles para el alineamiento D del ejemplo en la sección “Ejemplo de algoritmo para inferencia bayesiana”.
La topología con la máxima verosimilitud es la 7.

Topología 1 Topología 2 Topología 3
E4 E3 E4
E3 E2 E3
E2 E4 E2

E1 E1 E1

Topología 4 Topología 5 Topología 6
E3 E4 E2
E4 E2 E4
E2 E3 E3

E1 E1 E1

Topología 7 Topología 8 Topología 9
E4 E3 E2
E2 E2 E3
E3 E4 E4

E1 E1 E1

Topología 10 Topología 11 Topología 12
E4 E1 E3
E1 E4 E1
E3 E3 E4

E2 E2 E2

Topología 13 Topología 14 Topología 15
E1 E1 E2
E3 E2 E1
E4 E4 E4

E2 E3 E3

Tequio, enero-abril 2021, vol. 4, no. 11